jittor.mpi ===================== 计图分布式基于MPI(Message Passing Interface),本文档主要阐述使用计图MPI,进行多卡和分布式训练的教程。 ## 计图MPI安装 计图依赖`OpenMPI`,用户可以使用如下命令安装`OpenMPI`: ```bash sudo apt install openmpi-bin openmpi-common libopenmpi-dev ``` 也可以参考 [OpenMPI 文档](https://www.open-mpi.org/faq/?category=building#easy-build),自行编译安装。 计图会自动检测环境变量中是否包含`mpicc`,如果计图成功的检测到了`mpicc`,那么会输出如下信息: ``` [i 0502 14:09:55.758481 24 __init__.py:203] Found mpicc(1.10.2) at /usr/bin/mpicc ``` 如果计图没有在环境变量中找到mpi,用户也可以手动指定mpicc的路径告诉计图,添加环境变量即可:`export mpicc_path=/you/mpicc/path` `OpenMPI`安装完成以后,用户无需修改代码,需要做的仅仅是修改启动命令行,计图就会用数据并行的方式自动完成并行操作。 ```bash # 单卡训练代码 python3.7 -m jittor.test.test_resnet # 分布式多卡训练代码 mpirun -np 4 python3.7 -m jittor.test.test_resnet # 指定特定显卡的多卡训练代码 CUDA_VISIBLE_DEVICES="2,3" mpirun -np 2 python3.7 -m jittor.test.test_resnet ``` 这种便捷性的背后是计图的分布式算子的支撑,计图支持的mpi算子后端会使用nccl进行进一步的加速。计图所有分布式算法的开发均在Python前端完成,这让分布式算法的灵活度增强,开发分布式算法的难度也大大降低。 ## 如何从单卡代码适配多卡代码 使用`mpirun`时,以下几种模块会自动检测mpi环境并且自动切换成多卡版本: * jittor.optimizer: 自动同步梯度 * jittor.nn.BatchNorm*: 同步batch norm * jittor.dataset: 自动数据并行 用户在使用MPI进行分布式训练时,计图内部的Dataset类会自动并行分发数据,需要注意的是Dataset类中设置的Batch size是**所有节点的batch size之和**,也就是总batch size, 不是单个节点接收到的batch size。 大部分情况下,单卡训练的代码可以直接使用`mpirun`实现分布式多卡运行。 但仍然如下几种情况下,需要对代码进行调整: 1. 对硬盘进行写操作(保存模型,保存曲线) 2. 需要统计全局信息(validation 上的全局准确率) ### 对硬盘进行写操作 对于第一点,假设原来您的代码如下: ```python for i, (images, labels) in enumerate(dataset): output = model(images) loss = nn.cross_entropy_loss(output, labels) acc1 = accuracy(output, labels) SGD.step(loss) loss_data = loss.data writer.add_scalar("Train/loss") ``` 更改后的代码如下: ```python for i, (images, labels) in enumerate(dataset): output = model(images) loss = nn.cross_entropy_loss(output, labels) acc1 = accuracy(output, labels) SGD.step(loss) loss_data = loss.data if jt.rank == 0: writer.add_scalar("Train/loss") ``` 这里我们使用了 jt.rank 来限制,只允许第一个进程可以写 loss,这个代码在单卡下也是有效的,因为单卡的 jt.rank 值为 0, 需要注意的是,在 `if jt.rank == 0` 代码块里面的代码,不允许调用任何jittor的api,因为这很有可能导致多卡之间的api调用不一致而产生**死锁**! ### 需要统计全局信息 统计全局信息有两种方法,第一种是使用提供的 mpi op 来实现全局信息统计, 如下所示, 是一个validation的代码: ```python def val(epoch): global min_error model.eval() correct_nums = 0 for i, (images, labels) in enumerate(valdataset): output = model(images) correct_nums += top1error(output, labels) correct_nums.sync() top1_error = (valdataset.total_len - correct_nums.data[0]) / valdataset.total_len if top1_error < min_error: print("[*] Best model is updated ...") model.save('model_best.pkl') ``` 更改方案如下: ```python def val(epoch): global min_error model.eval() correct_nums = 0 for i, (images, labels) in enumerate(valdataset): output = model(images) correct_nums += top1error(output, labels) correct_nums.sync() if jt.in_mpi: correct_nums = correct_nums.mpi_all_reduce() top1_error = (valdataset.total_len - correct_nums.data[0]) / valdataset.total_len if jt.rank == 0 and top1_error < min_error: print("[*] Best model is updated ...") model.save('model_best.pkl') ``` 可以留意到我们首先使用了 `mpi_all_reduce`, 来统计多卡的正确数量(mpi_all_reduce会将多个mpi进程的结果累加起来), 然后在 `jt.rank == 0` 的情况下才更新模型。 第二种方法是使用`@jt.single_process_scope()`,被装饰的代码会直接以单进程的方式执行,无需处理多卡。 ```python @jt.single_process_scope() def val(epoch): ...... ``` ## MPI接口 下面是 jittor 的 mpi api reference. 目前MPI开放接口如下: * `jt.in_mpi`: 当计图不在MPI环境下时,`jt.mpi == False`, 用户可以用这个判断是否在mpi环境下。 * `jt.world_size`: 获取当前进程总数量,如果没有用mpi,则为1。 * `jt.rank`: 获取当前进程的编号,区间为`0 ~ jt.world_size-1`, 如果没有用mpi,则为0。 * `jt.mpi`: 计图的MPI模块。 * `jt.Module.mpi_param_broadcast(root=0)`: 将模块的参数从root节点广播给其他节点。 * `jt.mpi.mpi_reduce(x, op='add', root=0)`: 将所有节点的变量x使用算子op,reduce到root节点。如果op是'add'或者'sum',该接口会把所有变量求和,如果op是'mean',该接口会取均值。 * `jt.mpi.mpi_broadcast(x, root=0)`: 将变量x从root节点广播到所有节点。 * `jt.mpi.mpi_all_reduce(x, op='add')`: 将所有节点的变量x使用一起reduce,并且吧reduce的结果再次广播到所有节点。如果op是'add'或者'sum',该接口会把所有变量求和,如果op是'mean',该接口会取均值。 ```eval_rst .. automodule:: jittor_mpi_core :members: :undoc-members: .. automodule:: jittor_mpi_core.ops :members: :undoc-members: ``` ## 实例:MPI实现分布式同步批归一化层 下面的代码是使用计图实现分布式同步批归一化层的实例代码,在原来批归一化层的基础上,只需增加三行代码,就可以实现分布式的batch norm,添加的代码如下: ```python # 将均值和方差,通过all reduce同步到所有节点 if self.sync and jt.mpi: xmean = xmean.mpi_all_reduce("mean") x2mean = x2mean.mpi_all_reduce("mean") ``` > 注:计图内部已经实现了同步的批归一化层,用户不需要自己实现 分布式同步批归一化层的完整代码: ```python class BatchNorm(Module): def __init__(self, num_features, eps=1e-5, momentum=0.1, affine=None, is_train=True, sync=True): assert affine == None self.sync = sync self.num_features = num_features self.is_train = is_train self.eps = eps self.momentum = momentum self.weight = init.constant((num_features,), "float32", 1.0) self.bias = init.constant((num_features,), "float32", 0.0) self.running_mean = init.constant((num_features,), "float32", 0.0).stop_grad() self.running_var = init.constant((num_features,), "float32", 1.0).stop_grad() def execute(self, x): if self.is_train: xmean = jt.mean(x, dims=[0,2,3], keepdims=1) x2mean = jt.mean(x*x, dims=[0,2,3], keepdims=1) # 将均值和方差,通过all reduce同步到所有节点 if self.sync and jt.mpi: xmean = xmean.mpi_all_reduce("mean") x2mean = x2mean.mpi_all_reduce("mean") xvar = x2mean-xmean*xmean norm_x = (x-xmean)/jt.sqrt(xvar+self.eps) self.running_mean += (xmean.sum([0,2,3])-self.running_mean)*self.momentum self.running_var += (xvar.sum([0,2,3])-self.running_var)*self.momentum else: running_mean = self.running_mean.broadcast(x, [0,2,3]) running_var = self.running_var.broadcast(x, [0,2,3]) norm_x = (x-running_mean)/jt.sqrt(running_var+self.eps) w = self.weight.broadcast(x, [0,2,3]) b = self.bias.broadcast(x, [0,2,3]) return norm_x * w + b ```